Izbirni predmet: STRUKTURA IN FUNKCIJA PROTEINOV

Izvajanje: v letnem semestru vzporedno z rednimi predavanji iz Biokemije 1 (začetek sredi aprila, predvideni termini petek po 12h in ponedeljek po 15h). Termine bomo uskladili, da se ne bodo prekrivali z izbirnimi predmeti Rekombinantna tehnologija DNA in Biokemija steroidov.

Smer: splošna medicina, dentalna medicina

Pogoji za vključitev: vpis v tekoči letnik

Omejitev števila: omejitev ni

Vsebina predmeta: Predmet je namenjen poglobitvi znanja o proteinih skozi zgodbo od rojstva (biosinteze) do smrti (razgradnje) proteinov. Teme predmeta so:

1. Strukturna organizacija proteinov (od sekvence do kvartarne strukture)

2. Biosinteza proteinov (pregled sinteze citosolnih proteinov)

3. Potranslacijske modifikacije proteinov (najpomembnejše modifikacije in njihove funkcije)

4. Zvijanje proteinov (spontano in asistirano zvijanje)

5. Sortiranje proteinov (kam in kako proteini potujejo)

6. Receptorji kot primer membranskih proteinov (struktura, vrste in osnovni mehanizmi)

7. Nadmolekulske strukture iz proteinov (multiencimski kompleksi) ter proteinov in nukleinskih kislin (ribosomi, nukleosomi)

8. Razgradnja proteinov (uvoženih v lizosomih in lastnih s proteasomi)

9. Napake v strukturi proteinov kot vzrok bolezni (Alzheimerjeva bolezen, prionske bolezni, hemoglobinopatije)

10. Biološko aktivni peptidi (hormoni, nevrotransmiterji, antimikrobni peptidi, CPP-ji, peptidni toksini)

Metode poučevanja: Predmet poteka seminarsko, če število študentov to dovoljuje (do 40). Teme seminarjev so enake kot teme predmeta, ki so naštete zgoraj. Vsak seminar pripravi skupina največ štirih študentov. Osnovni vir za pripravo seminarja so ustrezna poglavja v knjigi Langel et al.: Introduction to peptide and protein chemistry, Francis and Taylor 2010. Študenti dobijo kopije poglavij in priporočilo, da dodatne podatke ter slike poiščejo preko Interneta. Vsaka skupina bo imela z nosilcem predmeta več osebnih konzultacij, nosilec predmeta pa bo tudi vedno dosegljiv preko Interneta. Zagovor seminarja bo obsegal 30 minutno s PowerPointom (do 30 slik) podprto predstavitev ter diskusijo, v kateri bomo skušali predstavljeno snov čim tesnje povezati s snovjo predmeta Biokemija 1. Če bo prijavljenih študentov več kot 40, seminarjev ne bo, zgoraj naštete teme predmeta pa bomo obravnavali na predavanjih (5 predavanj po dve uri). Literatura za študij je na voljo na Internetu (Študentske strani Inštituta za biokemijo MF).

Izpitni režim: Če se predmet izvaja seminarsko, se seminar oceni in ta ocena velja kot ocena predmeta. Če je študentov več kot 40 in se predmet izvede s predavanji, je prisotnost na predavanjih obvezna, na koncu pa sledi pisni izpit testnega tipa (30 vprašanj, vsako s 5 možnimi odgovori, eden je pravilen). Ocena izpita velja kot ocena predmeta.